Новый генный секвенсор преодолевает барьер в 1000 долларов благодаря GPU NVIDIA Tesla Графические процессоры NVIDIA Tesla лежат в основе новой системы Ion Proton от компании Life Technologies Corporation, которая более чем в 16 раз ускоряет первичный анализ генетических последовательностей, используемый для генерирования пар оснований ДНК. Эта инновация позволила сократить расходы на секвенирование целого генома человека до одной тысячи $ , в то время как 10 лет назад стоимость такого моделирования превышала 1 миллиард $ .

«GPU-ускорение и другие возможности системы Ion Proton позволяют любой лаборатории мира с легкостью провести секвенирование генома человека без дорогих затрат на IT, — отмечает Алан Уильямс (Alan Williams), вице-президент по программному обеспечению и разработкам подразделения Ion Torrent в Life Technologies Corporation. — Делая более доступным секвенирование геномов, мы надеемся увидеть взрыв инноваций в сфере биологических исследований и значительный прогресс в клинических испытаниях».

В системе Ion Proton используются передовые технологии, повышающие полосу пропускания, точность вычислений и количество блоков оснований, получаемых с помощью секвенсора Life Technologies Ion Personal Genome Machine® (PGM™) Sequencer, в котором также установлены графические процессоры для ускорения первичного анализа. Благодаря огромной мощности, секвенсор Ion PGM первым расшифровал геном бактерий E. coli, которые принесли в Германию смертоносную эпидемию в 2011 году.

Система Ion Proton устанавливает новые стандарты производительности, простоты использования и доступности исследований, позволяя изыскателям переходить с секвенирования сложных блоков к секвенированию уровня генома на одной платформе. Будучи в 5 раз дешевле систем секвенирования генома на основе света, эта система сэкономит изыскателям сотни тысяч $ .

«GPU-ускорение широко используется во всех аспектах вычислений в области бионаук, позволяя изыскателям выходить за рамки возможного, — отмечает Сумит Гупта (Sumit Gupta), директор по решениям Tesla в NVIDIA. — Темп исследований повышается благодаря использованию графических процессоров в широком спектре задач – от генных секвенсоров и анализа последовательностей до молекулярного моделирования и вывода диагностических изображений».